1、碱基G对TAMRA的猝灭机理研究。碱基G能够有效猝灭TAMRA,这种猝灭必须通过近距离接触实现,机理是光诱导电子传递(PET)猝灭方式。G位于TAMRA的同链或是异链时体现的整体猝灭效果一致,但猝灭形式不同:同链G对TAMRA的PET作用效率更高;互补链的G占据分子结构优势,PET荧光组分比例更高。G个数越多PET作用越明显,但没有观察到DNA链内各个碱基G之间的电荷传递作用。利用G能猝灭TAMRA荧光的性质可以动态监测杂交过程及定量衡量杂交程度,还可以得到一些特殊的结构信息,如发夹结构及分子链柔韧性等。

　2、TAMRA作为能量受体与供体荧光素(FAM)形成供受体对定量检测DNA分子结构的研究。FAM和TAMRA作为荧光共振能量转移作用(FRET)的供受体对,F(o)rster距离为62.4(A)。12bp、15bp DNA单标记链的FRET实验中,发现从荧光寿命均可观察到较明显的FRET现象,但是稳态光谱却只能观察到供体荧光的下降,而受体荧光无增强。此现象最终证实为增强的受体荧光被互补链的鸟嘌呤PET猝灭,故无法观察到受体荧光。利用加入受体前后供体荧光寿命的变化计算得到12bp、15bp DNA单标记链、15bp DNA双标记链的链长分别为55.5(A)、60.8(A)、56.4(A),与DNA的B构型模型的结构信息基木相符。

　　3、TAMRA标记在DNA上的构型研究。通过稳态光谱和瞬态光谱对TAMRA化学键合在不同序列。DNA链的研究,对TAMRA-DNA复合物的三种不同荧光寿命组分予以归属:第一,短寿命组分为G对TAMRA的PET猝灭途径的寿命组分;第二,中问寿命值与自由TAMRA相近,为TAMRA较自由伸展在溶液中的状态;第三,长寿命组分是TAMRA与DNA碱基形成的基态复合物的荧光组分。

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